Biyocoğrafik Soy Tayininde Kullanılan Ġnsersiyon Delesyon (ĠnDel) Lokuslarının Polimorfizminin Belirlenmesi

Creative Commons License

Filoğlu Tüfek G., Bülbül Ercan Ö., Arslan C.

I.Uluslararası TURAZ Adli Tıp ve Patoloji Kongresi, 13 - 16 Ekim 2016, ss.45-46, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Sayfa Sayıları: ss.45-46
  • Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
  • İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Adresli: Evet

Özet

Biyocoğrafik Soy Tayininde Kullanılan Ġnsersiyon Delesyon (ĠnDel) Lokuslarının

Polimorfizminin Belirlenmesi

Cemaleddin Arslan, Özlem Bülbül, Gönül Filoğlu, Arzu Düvenci

Amaç

Adli vakaların aydınlatılmasında ve sonuçlandırılmasında adli moleküler genetik biliminden

yararlanılır. Kimliklendirmede, genellikle STR/SNP genetik işaretleri kullanılmaktadır.

Genomda, İnsersiyon-delesyon (İnDel) sonucu meydana gelen kalıtımsal değişiklikler de,

genetik işaretler olarak kullanılabilinmektedir. Yeni nesil genetik varyasyonlar olan İnDel

polimorfizmi STR ve SNP lokuslarıyla birlikte kullanılmasıyla kimliklendirme ve

biyocoğrafik soy tayini daha başarılı yapılmaktadır. Ülkemizde STR/SNP genetik işaretlerinin

popülasyon içerisindeki sıklığı ile ilgili birçok çalışma mevcut olmasına rağmen, son yıllarda

tanımlanmış olan İnDel polimorfizmi için henüz Türkiye popülasyonuna ait veri oldukça

azdır. Bu lokusların adli kimliklendirmede ve biyocoğrafik soy tayininde kullanılabilmesi

için öncelikle popülasyonda görülme sıklığını belirlemek gerekir. Bu amaca yönelik olarak,

bu çalışmada 46 indel lokusunun Türkiye‟deki sıklığı belirlenmiştir.

Yöntem

Bu çalışmada, aralarında akrabalık ilişkisi bulunmayan, Türkiye‟nin tüm coğrafik bölgelerini

yansıtacak şekilde çalışmaya rıza gösteren sağlıklı 150 kişinin taze kan örnekleri

kullanıldı. Örneklerden ilk önce DNA izolasyonu ve biyocoğrafik 46 İnDel lokusunun PCR‟ı

yapıldıktan sonra 310 genetik analizör cihazında elektroforez gerçekleştirildi. Elde edilen

veriler Genemapper programında analiz edildi. Gen sıklıkları Arlequin v 3.5 Programı ile

yapıldı. Biyocoğrafik soy analizi için Snipper 2.0 programı kullanıldı.

Bulgular

İnDel profilleri 5 ana populasyon (Avrupa, Asya, Afrika, Amerika, Okyanusya) verileri ile

karşılaştırılarak Türkiye populasyonunun biyocoğrafik yapısı hakkında bilgi verici nitelikte

olduğu belirlendi. 46 İNDEL panelinden rs25584 lokusunun diğer toplumlarda nadir

görülürken Türkiye populasyonunda %28 sıklıkta görülmüştür.