Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa, Veteriner Fakültesi, Klinik Öncesi Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2016
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Haluk Çepoğlu
Danışman: Seyyal Ak
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:
Bu çalışmada,
tavuklarda vankomisin dirençli enterokokların saptanması ve kodlayan direnç
genlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. İstanbul ve
Balıkesir illerinin merkez ve çevre ilçelerinde belirlenen 12 yumurtacı tavuk
ve 6 broyler
kümeslerinden Kasım 2012 – Mayıs 2013 tarihleri arasında 300 tavuk dışkısı
(dışkılı altlık ve kloakal svab) toplandı. Bu örneklerin 220’ si yumurtacı
tavuklara ait kloakal svab, 80’ i broylerlere ait dışkılı altlık örnekleriydi.
Alınan örnekler Enterococcosel broth ve agarda kültüre
edildi, izole edilen şüpheli izolatların PCR ile cins düzeyinde identifikasyonları
yapıldı. Elde edilen Enterococcus
spp. izolatlarının fenotipik vankomisin dirençlerini belirlemek için 30 µg
vankomisin diski ile disk diffüzyon testi uygulandı. Test sonucunda dirençli ve
orta duyarlı çıkan izolatların vankomisin ve teikoplanin minimum inhibisyon
konsantrasyon (MİK) değerleri belirlendi. En son aşama olarak da fenotipik
dirençli enterokok izolatlarının, PCR ile vankomisinle ilişkili direnç genleri
ve tür düzeyinde identifikasyonları yapıldı.
Alınan örneklerden kültürel yöntemler sonucunda 107 adet
şüpheli izolattan PCR ile 98 adet Enterococcus
spp. izolatı elde edildi. Vankomisin disk diffüzyon testi sonucunda
izolatların 49’ unun dirençli, 48’ inin orta duyarlı ve 1’ inin duyarlı olduğu
belirlendi. Dirençli ve orta duyarlı 97 izolatın vankomisin MİK değerleri, 5’ i
dirençli, 83’ ü orta duyarlı ve 9’ u duyarlı olarak saptandı. Vankomisin MİK
testi sonucunda dirençli ve orta duyarlı olduğu belirlenen 88 adet izolatın
teikoplanin MİK değerleri, 2’ si dirençli ve 86’ sı duyarlı olarak bulundu.
Vankomisin MİK testi sonucunda fenotipik olarak dirençli ve orta duyarlı
oldukları belirlenen 88 izolatın direnç genlerini belirlemek ve tür düzeyinde
identifikasyonu için yapılan PCR sonucunda, 5’ i E. faecium (vanA), 29’ u E. gallinarum (vanC1), 54’ ü E.
casseliflavus (vanC2/3) olduğu
saptandı. Sonuç olarak %1,67 (5/300) E.
faecium (vanA), %9,67 (29/300) E. gallinarum (vanC1) ve %18 (54/300) E.
casseliflavus (vanC2/3)
vankomisin dirençli enterokok (VRE) saptandı.