Akciğerin sarkomatoid karsinomlarında met genetik değişiklikleri analizinde tanısal yöntemlerin karşılaştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: CANSU YOL
Danışman: ŞEBNEM BATUR
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Sarkomatoid karsinomlarda MET ekzon 14 atlama mutasyonları ve MET amplifikasyonlarının yüksek oranda pozitif olduğu saptanmıştır ve anti-MET tedavilere yanıtlar bildirilmiştir. Çalışmamızda, sarkomatoid karsinomlarda, İHK, FISH ve RT-PCR yöntemleri ile MET genetik değişikliklerini analiz edildi ve yöntemler birbirleriyle karşılaştırıldı. Materyal Metot: 2000-2018 yılları arasında tanı almış 55 olgu çalışmaya dahil edildi. Sonuçların birbiriyle ve klinikopatolojik özellikler ile ilişkisi değerlendirildi. MET genetik değişikliklerinin prognostik özelliklerine bakıldı. İstatistiksel analiz SPSS 21.0 programı kullanılarak yapıldı. Bulgular: Olguların İHK değerlendirmesinde, sarkomatoid komponnette METMab skorlamasına göre 13 (%23,6); H-skorlamasına göre 12 (%21,8) olgu İHK pozitifti. Diferansiye karsinom komponenti de değerlendirmeye dahil edildiğinde METMAb skorlamasına göre 15 (%27,2); H-skorlamasına göre 14 (%25,5) olgu İHK pozitifti. Tümörde, eşlik eden AK komponentinin olması ile İHK pozitifliği arasında anlamlı ilişki bulundu (p=0,013). Olguların 47'si FISH ile değerlendirildi. 47 olgunun 15' inda (%31,8) FISH (+) bulundu ve bunların 5' i (%10,6) amplifikasyondu. İHK boyanması gösteren alanlarda gen kopya sayılarında anlamlı artış görüldü (p=0,027). MET İHK pozitifliği ile FISH pozitifliği arasında zayıf korelasyon görüldü (Rho=0,253). Amplifikasyon gösteren olgular için, İHK duyarlılığı %60, özgüllüğü %73,8, pozitif prediktif değeri %21,4 ve negatif prediktif değeri %93,9 bulundu. 40 olguda MET ekzon 14 atlama mutasyonu analizi yapıldı. Formalinle fikse parafine gömülü dokudan izole edilen RNA konsantrasyonları ortalama 457,23 ± 306,69 idi. Tüm olgular MET ekzon 14 atlama mutasyonu için negatifti. Sonuç: İHK' nın düşük duyarlılığı nedeniyle FISH pozitif veya amplifikasyon pozitifliği için tarama testi olarak kullanılamayacağı düşünüldü. Ancak FISH değerlendirmesinin, İHK'da kuvvetli pozitiflik gösteren sarkomatoid morfolojideki alanlarda yapılmasının yararlı olacağını düşünüldü.