Hepatosellüler Karsinomada Peroksizom İlişkili Genlerin Ekspresyon Profillerinin İncelenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2024
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Sema ŞABANÇELEBİ
Danışman: Matem Tunçdemir
Özet:
Hücre içindeki metabolik aktivitelerde gerçekleşen değişiklikler kanserin en karakterize özelliklerindendir.
Peroksizomlar, kanser hücresi büyümesini ve hayatta kalmasını etkileyen organellerdir. Bazı kanser hücreleri,
bir enerji kaynağı olarak peroksizomal lipid yıkımı mekanizmalarını kullanmaktadır. Ayrıca, peroksizomal
lipid sentezi ve redoks dengesi, genellikle besin ve oksijen eksikliği olan tümör mikroçevresinde kanser
hücresinin hayatta kalmasını destekleyebilir. Hücresel redoks değişikliklerinin, gen ekspresyonu, hayatta
kalma ve çoğalma ile ilişkili sinyal yollarını modüle edebildiği ve peroksizomal lipit metabolizması tarafından
üretilen metabolitlerin lipit ikincil haberciler olarak işlev görebildiği göz önüne alındığında, peroksizomlar
kanserle ilişkili bir sinyal platformu olarak işlev görebilir. Peroksizomal metabolizmadaki değişikliklerin
kanserin etiyolojisi mi yoksa kanser hücresi proliferasyonu sırasında metabolik uygunluktaki değişiklikler
tarafından tetiklenen ikincil olaylar mı olduğu belirsizliğini koruyor. Bununla birlikte, bazı kanserlerin
büyümeleri için peroksizom aktivitesine bağlı olmaları, kanser hedefleri olarak peroksizomların potansiyelini
arttırır. Ayrıca, kanserde peroksizomal metabolizmanın düzensizliği, peroksizomal metabolitlerin serum veya
doku seviyelerini değiştirebilir. Bu nedenle, plazmalojenler gibi peroksizomal metabolizma tarafından üretilen
lipit türevleri, kanser tespiti için araçlar olabilir. Çalışmada hepatosellüler karsinomada daha önce ekspresyon
çalışması yapılmış olan datasetlerin verileri alınarak Geodataset analizi yapılacak ve genler tayin edilecektir.
Genlerin bu şekilde biyoinformatik analizlerle tayini hem maddi hemde zaman açısından tasarruf sağlanması
için önemlidir. HepG2(hepatosellüler karsinom hücresi) ve HUVEC(normal hücre) hücre hatları hücre
kültüründe büyütülecek. Ardından büyütülen hücrelerden nükleik asit izolasyonu yapılacaktır. Buradan elde
edilen nükleik asitler kullanılarak genlerin ekspresyon seviyeleri ölçülecektir. Kanser ile bu denli önemli
ilişkisi olan peroksizom ilişkili genlerin hepatosellüler karsinomda ekspresyon profilleri incelenerek
peroksizom yolağının hepatosellüler karsinom ile olan ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Elde edilen
veriler sonucunda literatüre peroksizom yolağındaki genlerin hepatosellüler karsinoma ile ilişkisini detaylı
şekilde gösteren bir katkı sağlanmış olacaktır aynı zamanda belirlenen genlerin biyobelirteç adayı olup
olmadığı araştırılmış olacaktır.