Akciğer kanseri hastalarında EGFR gen bölgesinin FISH yöntemiyle araştırılması


Creative Commons License

KURU R. D. (Yürütücü), ÇIRAKOĞLU A., YILMAZ Ş., ARGÜDEN Y., ASLANELİ ÇAKMAK B.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Diğer, 2019 - 2020

  • Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  • Destek Programı: BAP Diğer
  • Başlama Tarihi: Şubat 2019
  • Bitiş Tarihi: Temmuz 2020
  • Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Proje Özeti

Küçük hücreli olmayan akciğer kanserleri  (NSCLC) tüm akciğer kanserlerinin %85’ini
oluşturur. Hastaların ~%57 ‘si klinik metastaz  geliştirir. Günümüzde klasifikasyonları
histolojik (adenokarsinoma, yada squamos  hücreli karsinomalar gibi ) ve  onkojenik
mutasyonlara bağlı olarak alt grublara ayrılırlar. Ki bu mutasyonlar hastalığın  prognozunu direkt
etkilemektedir.. Genetik profillemeyle  akciğer  adenokarsinomaların ~%60’ının
üstünde driver mutasyonlar saptandı. EGFR, KRAS, BRAF  ve  HER2
 mutasyonları driver murasyonlar olarak kabul edilmektedir. EGFR  mutasyonu metastatik
küçük hücreli olmayan non squamos akciğer kanseri ve adeno karsinom hastalarında  kesinlikle
görülmektedir. EGFR mutasyonları adenokarsinomlarda  kişiye özgü tedavi amaçlı izlenebilir
moleküler hedeflerden biridir. Adenokarsinom akciğer kanseri  için  EGFR trozinkinaz
inhibitörü  (EGFR-TKI) hedef ilaç olarak geliştirilmiştir. Mutant kinazların EGFR TRK ile 
inhibisyonu  çok sayıda yolağın baskılanmasına yol açmaktadır. Bu da sıklıkla hücre büyümesinin
durdurulması ve hücre ölümüyle sonuçlanmaktadır. EGFR  kopya sayısı değişikliklerinin parafin
dokularda dual colour  Fluoresan İn Situ Hibridizasyon (FISH)  ile  araştırıldığı
çalışmalar bulunmaktadır.  Bilindiği üzere  FISH tekniği kopya sayısı değişimlerinin 
değerlendirilmesinde gold standarttır.
Biz de bu çalışmamızda akciğer kanseri hastalarının perifer kan örneklerinde EGFR  gen bölgesinin
kopya sayısını bu bölgeye özgü FISH probları kullanarak araştırmayı amaçladık. Tanı almış akciğer
kanseri hastalarından alınan perifer kan örneklerinden hazırlanan preparatlara  EGFR gen bölgesine
özgü DNA problarının kullanıldığı interfaz FISH (iFISH) yöntemi uygulanacaktır.
 Akciğer kanseri hastalarında tedavi süresince ilaca verilen yanıtın değerlendirilmesi için belli
aralıklarla biopsi yapılmaktadır. Bu işlem hem hasta için zahmetli olmakta, hem de alınan örnek bazen çok
küçük olmakta ve  moleküler çalışmalar için yetersiz olmaktadır. Hastaların arşiv perifer kanı
örneklerine  uygulanacak olan iFISH tekniğinin tedaviyi yönlendirebilecek  alternatif bir yöntem
olarak sunulabiceğini düşünmekteyiz.